1、按购买价格×扣减率购买农产品的税费。销售过程中的生产税与销售价格（含税÷（1）税率）×税率：例如，如果购买大米，则按照购买大米的价格计算税款。加工和销售大米的，应按照大米销售价格中包含的税款计算生产税。
2、”也就是说，纳税人购进用于生产或者委托加工13%税率货物的农产品，按照10%的扣除率，比一般规定的9%扣除率，再加计1%的扣除率。
3、农产品抵扣进项税的情形主要有以下几种：农业生产者销售农产品：农业生产者出售自己种植或者养殖的农产品，可以享受抵扣进项税的权利。这种情况下，进项税是指农业生产者在购买生产资料、设备或者其他服务等过程中缴纳的增值税或者其他税费。
4、针对不同的购进主体，一般纳税人购进农产品可抵扣进项税额计算如下：购入农业生产者销售的免税农产品，取得或开具收购发票，一般情况计算抵扣9%（发票买价×9%），深加工13%产品计算抵扣10%（发票买价×10%）。例1：从果农处购入其自产的水果一批（免税农产品），取得收购发票注明买价 10000 元。
收购农产品取得普通发票可以抵扣。公司纳税人，在购进农产品时收到了流通环节小规模纳税人开具的增值税普通发票，抵扣进项税额。
当从农业生产者手中购进农产品时，可以凭企业自行开具的农产品收购发票或销货方到当地税务机关开具的农产品销售发票，按照农产品买价和9%的扣除率计算进项税额。若农产品用于生产销售或委托加工13%税率的货物，则扣除率提高至10%。计算公式为：进项税额 = 买价 扣除率。
因此，可以可以抵扣进项税额的免税农产品发票包括两类，一是自产自销的农产品销售发票，二是农产品收购发票。两类发票的一个共同点，仅限于是自产自销。
以购进农产品为原料生产货物的计算方法：以购进农产品为原料生产货物为基础，农产品扣除率百分之9的计算公式为，当期允许抵扣的农产品增值税进项税额等于当期农产品耗用数量乘扣百分之9以（1加百分之9）。
农产品的销售价格为100元时，那么扣除率为百分之九，可以使用以下公式来计算农产品的增值税，农产品增值税等100除1加百分之九在乘百分之九。将数值代入公式后，可以得到农产品增值税等于100除1加百分之九在乘百分之九等于64元。
该计算方法基于农产品的用途和采购情况：农产品用于生产或加工13%税率的商品时：当期允许抵扣的农产品增值税进项税额的计算公式为：抵扣进项税额等于当期农产品耗用数量乘农产品平均购买单价乘扣除率除以（1加扣除率） 即：抵扣进项税额等于耗用量乘以平均单价乘以百分之9除以（1加百分之9）。
农产品扣除率9%如何计算介绍如下：农产品可以抵扣的进项税额=购进价款*9%。从农业生产者手中购进农产品，按销售发票和收购发票注明的买价和9%扣除率计算进项税。农产品可以抵扣的进项税额=购进价款*9%。
一般纳税人单位购进农产品，取得农产品销售发票或者收购发票，按9%的税率计算抵扣进项税额。农产品可以抵扣的进项税额=购进价款*9%。一般纳税人单位购进农产品的账务处理是，借：原材料等科目，应交税费—应交增值税（进项税额），贷：应付账款等科目。
法律分析：一般纳税人农产品加工生产企业缴纳增值税，一般的农产品收购税率为13%。销项税额减去进项税额等于应交增值税额。销项税额是指销售收入的税额，进项税额是指收购农产品的税额，一般的农产品收购税率为13%。增值税是以商品（包括应税劳务）在流转过程中产生的增值额作为计税依据而征收的一种流转税。
农副产品税收优惠政策可以根据纳税人购进农产品规定抵扣进项税额或者自产自销农产品免征增值税、企业所得税，再者“公司＋农户”经营模式免征企业所得税、销售畜禽免征增值税。
收购农产品取得普通发票的，也可以按照11%的扣除率计算进项税额。
增值税 农副产品如蔬菜、水果、畜牧产品等，在生产、销售环节需要缴纳增值税。增值税是一种流转税，是在商品生产、流通环节对增值额进行征税。农副产品生产者或销售者在销售产品时，需要按照规定的税率缴纳增值税。消费税 部分高价值农副产品，如烟草、酒类等，可能涉及消费税。
农副产品主要缴纳增值税和企业所得税。农副产品交税的具体情况包括以下几个税种： 增值税：农副产品生产者或销售者在销售过程中需要缴纳增值税。增值税是根据销售额计算的一种流转税，是一种消费税，旨在增加国家的财政收入。对于农业生产者自产的农产品，在销售时有免征增值税的优惠政策。
按照农产品收购发票或者销售发票上注明的农产品买价和10%的扣除率抵扣进项税额。法律依据：《财政部 国家税务总局关于免征蔬菜流通环节增值税有关问题的通知》对从事蔬菜批发、零售的纳税人销售的蔬菜免征增值税。蔬菜是指可作副食的草本、木本植物，包括各种蔬菜、菌类植物和少数可作副食的木本植物。